本发明公开了Myrtucommulone R及其在制备抗菌药物中的应用。所述的间苯三酚三聚体Myrtucommulone R结构如式I所示，是新的天然产物。该化合物在较低浓度下即对金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、万古霉素中介耐药金葡菌和耐万古霉素屎肠球菌等具有显著的抗菌活性，且对真核细胞毒性很低，预示它具有良好的药用前景，可以应用于制备抗菌药物制剂。抗菌药物制剂中含有Myrtucommulone R，余量为药用辅料或其它可配伍的药物；所述的抗菌药物制剂包括多种临床药物剂型。