本实用新型公开了一种柔性医药分拣设备，包括设备本体、运输带、分拣箱和柔性分拣装置，所述柔性分拣述第一电动机底部设有第一摇臂，所述第一摇臂底部设有第一绳索，所述顶部固定端中侧设有气动缸，所述气动缸右侧设有第二摇臂，所述第二摇臂底部设有第二绳索，所述顶部固定端右侧设有第二电动机，所述第二电动机底部设有第三摇臂，所述装置顶部设有顶部固定端，所述顶部固定端左侧设有第一电动机，所述第三摇臂底部设有第三绳索。该一种柔性医药分拣设备，通过在设备上设有柔性分拣装置，柔性分拣装置可以避免由于冲击载荷而导致的关节部件磨损的问题，采用柔性支链可以降低成本，检查周期可以达到6个月，本新型结构成本低，易于推广使用。