本发明提供一种治疗动物结膜炎和角膜炎的藏药组合物，所述藏药组合物由以下重量份数的各原料药制备而成：黄芩4～12份，三棵针4～12份，胡黄连4～12份，木贼3～9份，藏茵陈3～9份。本发明还提供其制备方法。本发明根据藏药理论和传统用药经验，结合临床技术方法，对治疗动物结膜炎和角膜炎的藏药组合物进行的药效筛选，其组方合理，安全有效，原料易得，制备工艺简单，操作简便，并经过临床应用试验验证，其治疗动物结膜炎和角膜炎作用效果显著，在医药临床上具有广阔的推广应用价值。