本发明涉及一种磁性脂肪酶纳米花催化材料及其制备方法和应用，属于酶固定化领域。一种磁性脂肪酶纳米花催化材料的制备方法，其特征在于：该方法是将硅基磁性Fe3O4纳米粒子分散到脂肪酶溶液中，再向其内滴加金属阳离子无机盐溶液，得到磁性脂肪酶纳米花，所述硅基磁性Fe3O4纳米粒子为经硅烷偶联剂处理的Fe3O4纳米粒子。本发明所得催化材料将脂肪酶‑无机杂化纳米花和磁性纳米颗粒二者优异的性能充分的结合在一起，从而在生物催化、生物医药、食品工业等各个领域都将有广泛的应用价值。