本发明涉及有机合成技术领域，尤其为一种甘氨鹅脱氧胆酸钠精制方法，S1，市售甘氨鹅脱氧胆酸钠加入水中，用酸的水溶液调pH值在弱酸性范围，有机溶剂萃取，水相用酸的水溶液调pH值范围到较强酸性，过滤，得到甘氨鹅脱氧胆酸；S2，甘氨鹅脱氧胆酸和有机碱在溶剂中加热搅拌成盐，冷却过滤，得到甘氨鹅脱氧胆酸有机碱盐；S3，甘氨鹅脱氧胆酸有机碱盐在溶剂中，用酸水溶液调pH值在较强酸性范围，过滤，洗涤干燥，得到甘氨鹅脱氧胆酸精制品。本发明的方法具有操作简单易行、工艺稳定、易于控制，后处理方便、安全环境友好等优点，可以进行大批量持续生产。