本发明公开了一种石杉碱甲分子印迹水凝胶微球的制备方法，其是以石杉碱甲作为模板分子，HPMC为功能单体，TEMED为催化剂，DVS为交联剂，采用反向悬浮聚合法制得所述石杉碱甲分子印迹水凝胶微球。该石杉碱甲分子印迹水凝胶微球具有较高的特异性识别能力，并具有缓释功能且适于口服，是一种新型的药物制剂。