一种二维码覆盖多码互补识别医药制品包装防伪方法，该防伪方法由医药生产商信息、医药经销商信息和医药销售商信息生成三幅暗码二维码图像，由医药基本信息生成一幅明码二维码图像，将每幅暗码二维码图像都互补的分割为两块以上平面图形图像，其中一部分图像称为缺码图像，另一部分图像称为补码图像，三幅暗码二维码图像的缺码图像互补的构成一幅暗码伪二维码图像，将暗码伪二维码图像和明码二维码图像利用同色异谱配色油墨重叠印制在医药制品包装上的二维码图像区上，在可见光下在医药制品包装的二维码图像区上显现明码二维码图像，通过扫描可获取明码二维码图像的信息，在红外光下医药制品包装的二维码图像区上显现暗码伪二维码图像，利用三幅暗码二维码图像的补码图像可分别生成三幅暗码二维码图像，通过扫描可获取每幅暗码二维码图像的信息，用这种方法可以鉴别医药制品是否存在假冒侵权问题。