本发明提供了一种快速鉴别硫酸软骨素原料的来源的HPLC法, 鉴别过程不需要样品预处理、直接对样品分析, 简单易行, 方法稳定, 结果准确, 极大缩短了鉴别时间；(2)本方法能够较好地实现对鲨鱼、牛、鸡或者猪来源的硫酸软骨素溯源问题。