本发明涉及一种无毒性产气荚膜梭菌β毒素基因工程疫苗。本发明制备的产气荚膜梭菌β毒素重组亚单位疫苗，系采用经过密码子优化、含有多个氨基酸突变的重组产气荚膜梭菌β毒素蛋白生产，即最大限度地保留天然毒素蛋白的完整性和空间构象，从而保持其免疫原性，又避免了单个氨基酸突变带来的生物安全隐患。该疫苗还具有制备工艺简单、免疫剂量低、疫苗效力优良等优点，较我国目前商品化的产气荚膜梭菌天然毒素灭活疫苗大大降低了疫苗生产过程中的生物安全风险，是我国现行B型和C型产气荚膜梭菌毒素疫苗升级换代的理想候选疫苗；而且在与其它抗原共同制备联苗时，无需增大联苗的使用剂量，即可制备联苗。