本发明公开了一种磁珠的制备方法及应用，属于磁性材料制备技术领域。该制备方法为，首先制备表面功能化的磁性纳米粒子，然后采用交联剂将至少两个表面功能化的磁性纳米粒子连接起来，制备出磁含量为70％‑98％的磁珠。本发明解决了现有磁珠磁含量低以及为了实现快速分离，极大地增加磁珠体积而导致悬浮稳定性降低的问题。另外，对于被捕获组分生物反应特别是免疫反应来说，本发明制得的小体积磁珠所导致的空间位阻显著降低，捕获能力和分析检测灵敏度提高，能够更好地用于生物医药分离与分析，特别适用于生物体液或反应液中细胞、细菌、病毒、DNA/RNA、蛋白质等的分离以及基于化学发光、电化学发光和荧光的临床生化快速自动化检测。