本发明属于医药技术领域，具体涉及一种卡泊芬净中间体及其合成方法。所述中间体合成方法包括以下步骤：将如式Ⅱ所示的化合物和溶解于溶剂A中的二氯亚砜混合，得到如式Ⅲ所示化合物。本发明使用二氯亚砜替代剧毒、恶臭、刺激性气味的硫醇或硫酚化合物，避免使用强腐蚀性酸，所形成的环状亚硫酸酯有利于反应物的构型保持；同时利用其易于离去及不改变反应物手性构型的性质，不经纯化直接引入乙二胺基团，缩短了反应步骤，减少了制备纯化的次数，提高了收率和纯度。