本发明涉及医药领域，公开了一种低乙醇残留的利培酮微球冻干方法，包括：1)冻干前处理；2)预冻：将隔板温度设定为‑40℃至‑10℃，保温1‑4h，将隔板温度经0.5‑3h升温到‑2℃至0℃，并保温0.5‑3h，隔板温度经0.5‑3h降低至‑40℃至‑10℃；上述预冻步骤至少重复一次；3)主干燥阶段；4)解析干燥阶段：隔板温度在2‑30h内升温至10‑40℃，保持1‑5h，真空度保持极限真空；隔板温度维持不变，真空度升高至10‑200mbar，保持0.1‑5h。本发明方法能够有效降低利培酮微球冻干后乙醇的残留量，可将乙醇残留量控制在0.2%以下。