本发明公开了一种可投送自主发光元件的分枝杆菌噬菌体及其应用，该噬菌体中含有能够使宿主细菌自主发光所需基因LuxCDABE，本发明构建的噬菌体噬粒的大小可达57kb以上，而现有λ噬菌体包装所能实现的最大载体不超过52kb。本发明噬菌体携带的自主发光元件存在于高效的转座子上，可以随着转座元件被高效地随机插入到宿主的基因组中，一方面可以破坏宿主的基因，另一方面，基因被破坏的宿主菌可以自主发光，便于利用自主发光这一特征高效地研究被破坏宿主基因的功能，可快速诊断样本中活的宿主菌以及快速检测宿主菌对药物的敏感性。这种诊断和检测比市面上最流行的BD MGIT 960系统要快8天左右的时间，而且更简便易行、直观且更经济。