本发明提供一种前列地尔冻干微乳组合物，所述组合物包含前列地尔、非离子型乳化剂、硫酸软骨素、阴离子型磷脂、冻干保护剂；其中，按质量百分比计，各原料与成分的量为：前列地尔0.001‑0.04％，非离子型乳化剂1‑55％，阴离子型磷脂0.1‑20％，油相0.6‑28％，冻干保护剂5‑98％；本发明所述组合物的包封率和稳定性得到显著提高，有利于降低游离药物浓度，减少制剂的血管刺激性，更安全、更稳定。