本实用新型公开了一种生物医药用洁净采样车，该洁净采样车包括箱体、高效过滤器、中效过滤器、初效过滤器和风机；高效过滤器设置在箱体的顶部且与风机连接；箱体两侧向外延伸出两侧盖，且高效过滤器、箱体和两侧盖围合形成工作区；风机、中效过滤器和初效过滤器依次纵向排列且均位于箱体的同一内侧。在使用过程中，由风机均匀送风，流经高速过滤器后，进入工作区，在工作区形成垂直单向气流，部分流回依次经过初效过滤器和中效过滤器，又回到高效过滤器后至工作区，在工作区循环；另一部分气流流出附近区域，使工作区产生负压，能够避免在进行粉尘等的分装时的造成的交叉污染，既能保证工作区的高洁净度环境，也能减少对人体的危害。