本实用新型涉及用于层析系统清洗的辅助管路。具体地，本实用新型提供一种用于层析系统清洗的辅助管路，所述的辅助管路包括进口端管路和出口端管路，所述的进口端管路包括第一“Y”型三通，所述第一“Y”型三通的两个支管形成50‑70°锐角，所述的第一“Y”型三通的支管与硅胶管相连；所述的出口端包括第二“Y”型三通，所述第二“Y”型三通的两个支管分别与硅胶管相连；所述第二“Y”型三通的主管与所述第一“Y”型三通的主管通过硅胶管相连，所述第二“Y”型三通的主管与所述第一“Y”型三通的主管相连的硅胶管上设有一混合器。本实用新型辅助管路每个流出口流出的清洗液流量和压力相同，且维护简单和易操作。