本发明提供一种阿加曲班起始原料异构体杂质的拆分方法，该方法包括以4‑甲基‑2‑哌啶甲酸乙酯消旋体为原料，用D‑(+)‑二苯甲酰酒石酸作拆分剂，成盐得到化合物Ⅰ所示的(2S, 4R)‑4‑甲基‑2‑哌啶甲酸乙酯‑D‑(+)‑二苯甲酰酒石酸盐，化合物Ⅰ在碱性条件下游离得到化合物Ⅱ所示的(2S, 4R)‑4‑甲基‑2‑哌啶甲酸乙酯，本发明提供的拆分方法，操作简便，拆分总收率达到45.8％，拆分后的手性纯度可以达到99.1％。