本发明公开了一种磁性复合金属有机骨架材料的制备方法，包括a)采用溶剂热法合成表面有氨基修饰的纳米磁性Fe3O4微球、b)引入铜盐后进行碱化合成中间体Fe3O4/Cu(OH)2和c)加入有机配体使中间体Fe3O4/Cu(OH)2转变成Fe3O4/MOF‑199，方法简单易操作、环保，所得到的Fe3O4/MOF‑199，可作为有机污染物的降解催化剂，在吸附、分离和生物医药等方面也具有潜在的应用价值。