本发明涉及肥料生产技术领域，特别公开了一种利用头孢菌素C滤渣生产功能性有机肥的方法。该利用头孢菌素C滤渣生产功能性有机肥的方法，以头孢菌素C滤渣为原料，其特征为往原料中加入强酸水解，得到水解液；往水解液中加碱中和后保温，得到有机肥母料；将有机肥母料进行真空浓缩，并添加中微量元素，经精滤，得到的滤液为功能性有机肥产品。本发明方法彻底解决了头孢菌素C滤渣的出路问题，工艺简单¸成本低廉¸产品功能性强，市场前景好，具有良好的社会效益和经济效益，具备工业化推广前景。