本发明公开了一种用于根管消毒的氯已定凝胶及其制备方法，本发明涉及根管治疗技术领域。本发明其原料按重量份比包括：氯已定0.5‑1份、利多卡因凝胶1‑2份、马来酸氯苯那敏0.2‑0.5份、甘油10‑12份、芦荟凝胶汁10‑14份、白凡士林6‑8份、纯净水60‑68份、青霉素0.5‑0.8份、四环素0.6‑1份和增稠剂4‑6份，具体包括以下步骤：S1、将白凡士林加入到加热皿内加热融化，加热时温度控制在70℃，然后通过保温箱保温在60℃，该用于根管消毒的氯已定凝胶及其制备方法，能够在根管消毒使用中具有很好的消毒效果，避免了根管治疗过程中患者受到细菌的感染，且具有很好的消炎效果，能够在根管治疗后防止手术部位感染，一定程度上保证了根管治疗的安全性。