本实用新型公开了一种冷冻干燥机温度探头结构，包括上层板、固定滑轨、滑动件、第一温度探头、第二温度探头及透明胶布，固定滑轨固定于上层板，固定滑轨包括本体及第一导向棱，第一导向棱设有若干第二固定孔，滑动件包括凸起，凸起设有第一固定孔，第一温度探头、第二温度探头通过透明胶布固定于滑动件表面上，滑动件设有第一导向槽，当调节到需要位置时，通过一卡扣件穿过第一固定孔及第二固定孔使第一温度探头及第二温度探头相对于上层板的位置固定。可根据人为需求调整第一温度探头、第二温度探头的位置，进而准确测量上层板的位置，使冻干工艺的温度控制更加准确，同时温度探头的可控性强，调节方便。