本发明提供了一种从发酵液中提取纯化普伐他汀钠的方法，属于生物医药制备领域。本发明通过对发酵液碱化、酸化去除大量杂质和色素，以吸附剂将酸化液中有效成份富集，提高了萃取底物的纯度并大大减少了萃取底物的量进而提高了萃取液的质量；整个生产过程中采用单一溶媒体系，工序不繁杂，产生的三废量较低，适于规模化生产。本发明方法生产的普伐他汀钠含量在98.8％以上，主要杂质6‑表普他汀＜0.15％，总有关物质＜0.4％，产品质量符合合格普伐他汀钠的EP9.6版质量标准(普伐他汀钠含量在97.0～102.0％，主要杂质A即6‑表普他汀≤0.3％，总有关物质≤0.6％)，总收率可达75％以上，规模化生产前景良好。