本发明提供了莫达非尼与帕罗西汀的组合用于治疗抑郁症的应用。其中，所述抑郁症伴有认知功能损伤，优选的莫达非尼与帕罗西汀的质量比为0.01 : 1至0.1 : 1。本发明提供的这种组合可显著改善发作期抑郁症的症状，并且同时改善认知功能损伤，特别是增强学习和记忆能力，另外在改善抑郁和改善认知方面具有协同增效作用。