本发明提供一种基于百合多活性成分指标的综合质量评价方法，包括以下步骤：(1)通过对百合多糖的含量测定，建立王百合苷A、对香豆酸、没食子酸的含量测定方法以进一步增加对百合质量控制的专属性评价，初步判别百合品种真假及质量优劣；(2)采用特征图谱对百合进行评价，用于增加对百合品种真假、优劣的鉴别，以及对百合质量均一性、稳定性的评价；(3)建立多活性指标成分综合评价体系对百合的质量进行全面评估，以比较得出百合质量的优劣；多活性指标成分包括王百合苷A、对香豆酸、没食子酸、百合多糖。综合评价有利于更全面、准确地评定百合的质量及品种类别，避免掺假、提高疗效、规范市场实行优质优价、促进传统中医药健康发展。