本发明涉及医药、食品、化工原料技术领域，具体涉及一种右旋糖酐发酵液制备果糖浆的方法。其首先采用板框过滤、陶瓷膜微滤及5000膜超滤，将果糖从右旋糖酐发酵液中分离出来；然后在75℃下减压浓缩至浓度40%，活性炭脱色；先后经过阳离子交换树脂和阴离子交换树脂的离子交换层析；最后在55℃下减压浓缩至浓度71%得到果糖浆。本发明制备方法将膜过滤与传统果糖浆生产工艺想结合，将右旋糖酐生产中占蔗糖转化产物52%的果糖从发酵液中分离制备出来，大大减轻了企业的环保负荷，使废弃物得到有效利用，既增加了经济效益，又产生了环保效益。所制备的果糖浆可用于食品生产和其他相关工业生产。本发明采用的工艺步骤为1)分离果糖；2)制备果糖浆。