本发明属于农业生物技术领域，具体涉及一种真菌来源的酸性蛋白酶Bs2688突变体及其基因和应用。本发明蛋白酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示。本发明提供了一个新的蛋白酶基因，利用基因工程手段生产性质优良的蛋白酶，并将其应用于饲料、食品、医药等工业。