本发明属于医药领域，特别涉及一种治疗功能性子宫出血的凝胶制剂及其用途。该凝胶制剂的活性成分为爱维莫潘或爱维莫潘与伊可妥因的组合物，其中爱维莫潘与伊可妥因的重量份比为：爱维莫潘1重量份、伊可妥因3～5重量份。本发明的凝胶制剂外用给药或经阴道局部给药具有缩短功能性子宫出血的出血时间的作用，爱维莫潘或伊可妥因单独使用即可发挥效果，联合使用时效果进一步提高。