本发明公开了一种提高甘油酯型鱼油中EPA和DHA含量的方法，所述方法为：以米曲霉WZ007经发酵培养获得的湿菌体用pH值为7.0的磷酸缓冲液悬浮后冷冻干燥制成的冻干菌体为催化剂，以甘油酯型鱼油和乙酯型鱼油为底物，在米曲霉脂肪酶的作用下进行酯酯交换反应合成高含量EPA\DHA甘油酯鱼油；本发明所述中间体的制备方法所用脂肪酶的催化效率高，催化剂可以重复利用，下游分离简单，能耗低，大大降低了生产成本，环境污染小，适合工业化生产。