本发明涉及一种高压脉冲电场偶联生物酶解制备鲍鱼内脏磷脂的方法，属于水产食品精深加工领域。该方法制备步骤依次为：原料预处理、PEF偶联生物酶解、脂质提取、硅胶柱层析分离磷脂、蛋白提取、醇提多糖等手段，依次得到鲍鱼中磷脂、中性脂肪、蛋白、多糖、色素等。本发明操作工艺简单，成本低，针对我国鲍鱼产业加工中的副产品——内脏进行精深加工和综合利用，制备得到的鲍鱼磷脂、蛋白、多糖和色素等可作为中间原料应用于食品、医药等各个领域。本发明技术适用于各种规模的工业化生产，有效解决鲍鱼生产加工业的废弃物排放。