本发明提供一种匿名化数据传输系统，包括业务中心模块、管理中心模块、工具箱模块，业务中心模块包括CRC侧影像列表子模块、上传影像子模块、PM侧影像列表子模块、申办方项目列表子模块，管理中心模块包括匿名方案管理子模块、人员配置子模块、项目管理子模块、医院管理子模块、日志管理子模块、公告管理子模块、系统设置子模块。本发明通过在上传时正确填写匿名信息，上传完成后的DICOM影像数据自动被匿名，规避了受试者信息泄露的风险，系统管理员通过匿名方案管理、人员配置、项目管理、医院管理、日志管理、公告管理、系统设置等功能，根据每个项目的不同要求设置项目信息、人员信息、匿名方案信息等，节约成本，阅片中数据转移流程更规范和严谨。