本发明提供了一种4, 6‑二氯‑2‑甲硫基嘧啶的制备方法，以4, 6‑二羟基‑2‑甲硫基嘧啶为原料，用草酰氯作为氯化试剂氯化，在溶剂中反应制得4, 6‑二氯‑2‑甲硫基嘧啶。本发明的有益效果体现在：整体工艺流程简单、无含磷废液及废固体产生、收率高、能稳定控制产品质量、适于工业化生产。