本发明公开了一种用于检测自身免疫病患者血清标志物的多肽组合物及其应用，本发明属于医药技术领域。本发明从噬菌体随机肽库中筛选出对自身免疫性疾病血清标志物具有结合能力的多肽，通过人工合成，用于血清标志物的免疫学检测。所述的多肽组合物包括SEQ ID NO.1‑19所示序列的全部或部分。此外，本发明还公开了含有所述多肽组合物的芯片、酶联免疫反应板以及试剂盒。本发明得到的多肽序列对自身免疫性疾病患者血清标志物具有良好的结合能力，可用于自身免疫病的诊断和评价。