本发明公开了一种甲磺酸达比加群酯微丸及制备方法，属于医药技术领域。该微丸的结构包括丸芯、包裹在丸芯外层的隔离层，包裹在隔离层外层的含药层；其中丸芯含有甘氨酸和羟丙甲纤维素；隔离层含有羟丙甲纤维素酞酸酯和滑石粉；含药层含有甲磺酸达比加群酯、甲基丙烯酸甲酯和滑石粉。本发明制备的微丸隔离层表面圆整，没有所谓的卫星颗粒，不影响隔离层的完整性，从而使得活性成分和甘氨酸在空间上的有效隔离，保证制剂在储存过程中的活性成分的稳定性。本发明制备的甲磺酸达比加群酯微丸具有预防和治疗脑缺血和全身性栓塞疾病的作用。