本发明提供一种包含干细胞的抗衰老组合物及其应用，属于生物医药技术领域，所述组合物具体包括：a)干细胞；b)参与免疫应答的免疫细胞；c)IPS细胞提取物；以及d)保护剂，所述保护剂具体是重量比为1 : 15.8～16.0的葡多酚和梓醇的混合物。本发明组合物中的干细胞、免疫细胞和IPS细胞提取物联用可清除衰老死亡及癌变细胞，清洁机体微环境，保护人体细胞增殖并活化，进一步发挥再生及修复作用，延缓衰老，同时还可以逆转衰老损伤，高效率地促进伤口愈合、骨质成长。