本实用新型公开了一种内镜清洗消毒工作站，包括箱体，所述箱体上从左到右依次排序的初洗槽、酶洗槽、次洗槽、消毒槽和末洗槽，所述初洗槽、酶洗槽、次洗槽、消毒槽和末洗槽的上方均设有喷淋装置，所述消毒槽的四个侧壁上均设有凹槽，所述凹槽内设有通孔，所述通孔的后方设有排风装置，所述排风装置固定在箱体内。本实用新型通过在消毒槽内设置通孔，然后在排放装置的作用下，将难闻或有害的气体排出到气体处理装置内，避免了操作员的身体受到伤害。