本发明公开了一种药用植物的分离方法及其产品和应用。该分离方法其包括如下步骤：(1)将骆驼蓬子乙醇提取液进行MCI小孔吸附树脂层析，所述小孔吸附树脂层析的流动相为乙醇水溶液，得有效成分粗品；(2)将步骤(1)所述有效成分粗品进行高效反相层析，所述高效反相层析的流动相为甲醇和三氟乙酸水溶液，得有效成分。本方法从骆驼蓬子中提取的有效成分纯度高，制备工艺所使用的溶剂均为无毒无害的溶剂，工艺技术稳定，产品质量可靠。