本发明公开了一种移动放射源隔离控制系统。包括：时间控制模块、射线监测模块、电机驱动模块、电动门栅，电动门栅设于封闭监控区的电子防护门的内侧，时间控制模块根据位于封闭监控区内的移动放射源的放射性物质的半衰期通过电机驱动模块控制电动门栅的开关状态，射线监测模块根据移动放射源的射线值控制电子防护门的锁闭状态。本发明通过将移动放射源放限制在封闭监控区内，并基于移动放射源放的射性物质的半衰期和实时射线值设置双重门禁，实现了当移动放射源存在辐射危害时限制其活动范围避免其对医护人员和外围民众造成危害，当移动放射源没有危害时自动解除对其的活动限制。