本发明公开了一种基于中医药文献的核心药物识别方法，包括以下步骤：建立治疗特定疾病的中医药文献语料库；构建治疗特定疾病的药物网络；对药物网络进行社区发现，发现治疗特定疾病的核心药物。本发明通过计算机自动分析大量中医药文献，让计算机分析药物之间的语义，进而计算药物之间的语义相似度，构建针对某一疾病的药物网络，再利用复杂网络的分析方法，发现核心药物组合，降低工作量和主观性，提高准确性。