本发明公开了一种小分子透明质酸或其盐的制备方法，属于生物工程技术领域。本发明使用由菌种保藏号为CGMCC NO.16836的植物乳杆菌发酵生产制得透明质酸酶溶液，该透明质酸酶溶液酶解分子量介于500kDa‑700kDa透明质酸或其盐，制得小分子透明质酸或其盐的分子量介于1kDa‑60kDa；小分子透明质酸酶解液经酶灭活、活性炭吸附除杂、过滤微孔膜滤、低温喷雾干燥得到小分子透明质酸或其盐。本发明所得产品安全性高、透皮吸收性好、极大保证了分子结构的完整性及生物活性，应用广泛。