本发明涉及化学合成领域，具体涉及一种质子泵抑制剂(PPI)原料药合成新工艺，特别涉及一种埃索美拉唑镁的制备方法。本发明采用5‑甲氧基‑2‑巯基苯并咪唑和2‑氯甲基‑3, 5‑二甲基‑4‑甲氧基吡啶盐酸盐为起始原料，经过缩合、不对称氧化、成盐来制备埃索美拉唑镁，湿品直接用水和甲醇精制，中间体无需结晶、过滤和干燥，简化了操作步骤，缩短了生产周期，减少了处理过程中的物料损失和能源消耗，提高了收率，实现了良好的经济效益和社会效益。该制备方法重复性好，操作简单，提高了埃索美拉唑镁的收率和纯度，易于工业化生产。