本发明涉及基因工程领域，具体地，本发明涉及一种耐高温酸性果胶酶PAGL8及其基因和应用。本发明提供了一种来源于黑曲霉Aspergillus niger L75的果胶酶PAGL8，其氨基酸序列如SEQ ID NO.1或3所示，且本发明提供了编码上述果胶酶的编码基因pagL8，其核苷酸序列如SEQ ID NO.4或6所示。本发明的果胶酶具有以下性质：最适pH 5.0，最适温度50℃，具有较好的热稳定性，75℃处理10min剩余70％的酶活力。作为一种新型的酶制剂，可应用于饲料、食品等行业。