本发明公开了一种酯酶PHE21及其编码基因和应用。本发明从海洋假单胞菌(Pseudomonadaceae oryzihabitans)HUP022中克隆到了一个酯酶基因PHE21，全长为966bp，其编码的酯酶PHE21共包含321个氨基酸。酯酶PHE21对多种金属离子、有机溶剂和表面活性剂有很好的耐受性；同时酯酶PHE21可用于制备(S)‑3‑羟基丁酸乙酯，利用重组表达的酯酶PHE21作为催化剂，制备得到了光学纯度大于99％的(S)‑3‑羟基丁酸乙酯(转化率65.15％)。酯酶PHE21具有反应专一性强、催化效率高的优点，在生物医药和精细化工领域具有非常大的应用前景。