本发明提供lncRNA11496在诊治弓形虫病中的应用，属于生物医药和分子生物学技术领域。经研究发现，NONMMUG011496(lncRNA11496)在微阵列感染的弓形虫感染的小鼠脑组织中显著下调；同时弓形虫慢性感染小鼠脑组织中lncRNA11496的表达影响神经细胞的增殖、分化及凋亡，与弓形虫感染密切相关。lncRNA11496是在弓形虫慢性感染脑组织中首次发现的一种非编码RNA。因此，lncRNA11496可以作为一种重要的生物靶标，为弓形虫脑病的诊断和基于lncRNA11496为靶向的抗弓形虫药物研发提供了依据，具有良好的实际应用之价值。