本发明公开了一种来源于产酸克雷伯菌(Klebsiella oxytoca)的葡甘聚糖酶基因及其酶的制备方法与应用，即利用基因工程的技术方法，将该葡甘聚糖酶的基因克隆到大肠杆菌表达载体上，获得可异源表达该酶的大肠杆菌重组菌株，该菌株异源表达制备的葡甘聚糖酶，能高效降解魔芋多糖(又称魔芋葡甘聚糖)。本发明提供的葡甘聚糖酶可广泛应用于农业、食品、饲料添加剂、医药及葡甘露低聚糖制备等领域。