本发明公开了一种来源于蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)的岩藻多糖酶基因及其酶的制备方法与应用，即利用基因工程的技术方法，将该岩藻多糖酶的基因克隆到大肠杆菌表达载体上，获得可异源表达该酶的大肠杆菌重组菌株，该菌株异源表达制备的岩藻多糖酶，能高效降解岩藻多糖。本发明提供的岩藻多糖酶可广泛应用于农业、食品、饲料添加剂、医药及低分子量岩藻多糖的制备等领域。