本发明公开了一种来源于海南土地杆菌(Pedobacter hainanensis Q‑13)的κ‑卡拉胶酶基因及其酶的制备方法与应用，即利用基因工程的技术方法，将该κ‑卡拉胶酶的基因克隆到大肠杆菌表达载体上，获得可异源表达该酶的大肠杆菌重组菌株，该菌株异源表达制备的κ‑卡拉胶酶，能高效降解κ‑卡拉胶。本发明提供的κ‑卡拉胶酶可广泛应用于农业、食品、饲料添加剂、医药、化妆品及卡拉胶寡糖制备等领域。