本发明公开了一种来源于嗜热毁丝霉菌的多糖裂解单加氧酶LPMO 9D的编码基因及其酶的制备方法与应用。本发明所涉及的多糖裂解单加氧酶LPMO 9D来源于嗜热毁丝霉菌(Thermothelomyces thermophila ATCC 42464)。本发明还提供了一种制备该新型多糖裂解单加氧酶的方法，即利用基因工程的技术方法，将该新多糖裂解单加氧酶的基因克隆到毕赤酵母表达载体上，获得可异源表达该酶的毕赤酵母重组菌株，用该菌株异源表达制备的多糖裂解单加氧酶LPMO 9D可以降解PASC(用磷酸处理过的微晶纤维素)生成纤维寡糖和纤维寡糖酸。本发明提供的多糖裂解单加氧酶LPMO 9D可广泛应用于化工、农业、饲料添加和医药等领域，具有较大的生产潜力和经济价值。