本实用新型涉及一种AGV进料小车自动升降隔离门装置，包括AGV进料小车和位于AGV进料小车前侧下方的进料口，进料口处设置有升降门，升降门的顶部两侧分别设置有升降电机，升降门通过升降电机带动升降，升降门的两侧设有支架，支架上安装有接近开关，AGV进料小车上设置有控制器，控制器分别连接升降电机和接近开关。本实用新型在AGV进料小车的进料口处设置了升降门，当升降门处在关闭状态，有效保护AGV进料小车内部环境洁净度，当AGV进料小车与冻干箱取料口对接后处在层流保护下时，AGV进料小车升降门自动打开，进行物料转移，转移物料的整个过程中，内部环境与外界(无菌室)始终保持隔离状态，消除了物料污染风险。