本发明涉及一种通过沉淀聚合制备聚合物弹性微球的方法。该方法以乙腈等为反应介质，以多异氰酸酯化合物和多元醇或多元胺为单体，通过使用长链多元醇或长链多元胺在聚合物中引入软段相区制得聚合物弹性微球。与现有技术相比，本发明方法简单、原料单一，反应时间短，单体装载量高，高效节能且生产成本低，有利于实现微球的工业化生产及应用。本发明无需任何乳化剂或稳定剂，所得微球非常洁净，可应用于生物医药等领域。所得聚合物微球具有高弹性和高度单分散性，通过改变实验条件可对微球的弹性和粒径进行调整，满足不同场合对微球弹性及大小的需求。