本发明公开了一种工程造价评估方法及系统，该方法包括如下步骤：建立有维度、类型和层级关系的建筑工程造价评估指标表；通过建筑工程造价评估指标表对参与评估的开发项目进行自动化造价评估分析；根据评估分析结果自动生成对应开发项目的造价评估疑点表。能灵活的设计出建筑工程造价指标表，利用多指标维度充分考虑不同因素下的建筑安装工程单方造价指标，让工程造价评估不再透明化，标准化，给税务局人员于直观的表格展示，提供工程造价审核依据，节省税务局审核人员的计算时间，大大节省了针对具体房地产开发项目的工程造价评估时间。